Hatchepsout, l'aînée de deux filles, était la fille du roi Thoutmosis et de la reine Ahmse. Après la mort de son père, Hatchepsout fut forcé d'épouser son demi-frère Thoutmosis ll. Ainsi, Thoutmosis II devint roi après la mort de son père vers 1492 av. J.-C. Lui et Hatchepsout eurent une fille, Neferu-Ra.
Thoutmosis II mourut jeune en 1479 av. J.-C. Il avait aussi eu un autre fils d'une épouse secondaire, Thoutmosis III. A sa mort, c'est logiquement son fils qui hérita du trône, mais il était trop jeune pour régner. C'est donc Hatchepsout qui régna sur le pays en tant que régente en attendant que son beau-fils atteigne la majorité.
Mais grâce à un tour de passe-passe dans la septième année de sa régence, elle changea les règles pour se faire couronner pharaon d'Égypte au détriment de Thoutmosis III.
Anecdote amusante, Hatchepsout avait été représentée comme une femme dans des statues et des sculptures lorsqu'elle était régente. Après son couronnement en tant que reine, elle commença à être représentée avec des robes masculines et est progressivement devenu représentée avec un physique masculin.
Hatchepsout avait estimé qu'elle avait le droit de gouverner l'Égypte comme n'importe quel homme. Son apparence masculine n'était pas destinée à manipuler les gens en leur faisant croire que leur pharaon était un homme, elle servait à montrer qu'elle aussi était un pharaon.
Hatchepsout a vécu une vie paisible; elle a construit de nombreux temples et s'est concentrée sur l'économie égyptienne en menant des activités commerciales très rentables. Cependant, tout le monde n'aimait pas ses réalisations. À sa mort, Thoutmosis III récupéra son trône. Il est également considéré comme un grand pharaon et il a été surnommé par certains historiens comme le « Napoléon de l'Égypte ancienne » pour ses victoires militaires. Par rancune envers Hatchepsout qui lui avait volé son trône, il fit détruire presque tout ce qu'Hatchepsout avait construit durant son règne. Il voulait faire détruire toutes les preuves de son existence.
D'après certains historiens, elle avait construit deux obélisques de granit rouge avec son nom gravé dessus. Thoutmosis III aurait fait détruire ces obélisques.
Cela explique pourquoi Hatchepsout est restée largement méconnue jusqu'au 19ème siècle à l'inverse de Cléopâtre. Aujourd'hui, cela est universellement reconnu, Hatchepsout a accompli ce qu'aucune autre femme n'avait avant elle. Elle a gouverné la civilisation la plus puissante pendant plus de 20 ans.